东北制药的子公司有:23个,分别是:东北制药集团供销有限公司、上海益东投资合伙企业(有限合伙)、沈阳东北制药装备制造安装有限公司、东北制药集团沈阳第一制药有限公司、沈阳东北大药房连锁有限公司、东北制药集团辽宁生物医药有限公司、沈阳东北制药进出口贸易有限公司、东北制药集团销售有限公司、东北制药集团沈阳云创科技有限公司、沈阳百万运输有限公司、上海东药汉飞企业发展有限公司、沈阳东北制药设计有限公司、沈阳东瑞精细化工有限公司、东北制药丹东医药有限公司、东北制药锦州医药有限公司、东北制药集团大连医药有限公司、东北制药集团(宁波)销售有限公司、东北制药集团营口医药有限公司、东药乌海化工有限公司、东药集团朝阳医药有限公司、东药集团葫芦岛医药有限公司、甘肃东药明祖堂医疗器械有限公司、甘肃方大富凰东西协作制衣有限公司